撒哈拉以南的南部非洲是艾滋病流行最严重的区域，无保护的异性性行为引起的垂直和水平传播是艾滋病扩散的主要途径。部分地区与多性伴以及其他性传播 疾病密切相关。根据分子流行病学分析，非洲可以被划分为不同的区域，在中非如喀麦隆、加蓬、刚果，以及前扎伊尔等国家几乎目前所有的Ｍ组各亚型，甚至０组 都已经被报道。Ｎ组的分离株最近也在喀麦隆被发现。

  这一地区多种亚型的同时流行很明显是造成当前大量亚型问重组型的出现（包括Ａ/Ｄ、Ａ /Ｇ、Ａ/Ｃ、Ｂ/Ａ、Ａ/Ｄ、Ａ/H、Ａ/Ｇ、Ｃ/Ａ/Ｇ/Ｊ等等）重要原因。值得注意的是该地区艾滋病的发病相对其他非洲国家并不高。这表明，病毒基 因的变异程度并不一定与病毒的传播快慢有关。

  可能是以下原因造成了中非地区病毒的基因多变性：

第一，中非是艾滋病最早出现的地方；

第二，人与黑猩猩之间的可能存在多种交叉传染；

第三，该地区存在多种种族，为病毒的变异提供了有利条件；

第四，社会经济和政治的变化，导致性乱的泛滥，不同毒株的重组更加造成了中非地区病毒的多样性。

  在 南部非洲国家，例如博茨瓦纳、津巴布韦、南非、赞比亚、莫桑比克、马拉维，艾滋病蔓延极其严重，其中Ｃ亚型是最多的。南非是撒哈拉以南非洲地区唯一有Ｂ亚 型流行的国家，目前其国内有两个亚型在流行：Ｂ亚型通过同性性行为传播，Ｃ亚型主要通过异性性行为传播。埃塞俄比亚主要流行Ｃ亚型。

  在东部非洲国家，如乌干达、肯尼亚、坦桑尼亚等，Ａ亚型和Ｄ亚型占主导地位，亚型不多。布隆迪和卢旺达是以A亚型和Ｃ亚型占主导。

  在 西非（尼日利亚、加纳、马里）主要存在Ａ亚型和Ｇ亚型。也发现了ＡＧ重组型。在摩洛哥，Ｂ亚型占主导，Ａ、C和以D亚型也有少量存在。摩洛哥和南非是非洲 国家中仅有的Ｂ亚型占主导国家。这可能因为摩洛哥旅褥看是传播的主要来源，而在南非，B亚型则主要是与欧洲和美国的同性性接触传播的。以上事实表 明，HIV-1在非洲的分布是十分不均一的。

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